En dehors de la version web, WhatsApp n'a jamais développé d'application Linux native comme c'est le cas sur macOS et Windows.

Cette application tierce vient combler le manque et elle est désormais disponible aussi en Flatpak.

ZapZap est un client Whatsapp desktop non officiel qui intègre la version web de Whatsapp. Il peut tourner en tâche de fond, et afficher l'arrivée de nouveaux messages avec une icône différente dans la barre des tâches.

https://github.com/rafatosta/zapzap